PubMed Central

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PubMed Central
ProdutorBiblioteca Nacional de Medicina dos Estados Unidos (Estados Unidos)
História2000 até o presente
Acesso
CustoSem custos
Cobertura
DisciplinasMedicina
Profundidade de registroÍndice, resumo e texto completo
Cobertura de formatoartigos de jornal
Links
Local na rede Internethttps://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/
Lista (s) de títuloshttps://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/journals/

PubMed Central ( PMC ) é um repositório digital gratuito que arquiva artigos acadêmicos de texto completo de acesso aberto que foram publicados em periódicos biomédicos e de ciências da vida . Como um dos principais bancos de dados de pesquisa desenvolvidos pelo National Center for Biotechnology Information (NCBI), o PubMed Central é mais do que um repositório de documentos. As submissões ao PMC são indexadas e formatadas para metadados aprimorados , ontologia médica e identificadores exclusivos que enriquecem os dados estruturados XML para cada artigo. [1] O conteúdo dentro do PMC pode ser vinculado a outros bancos de dados NCBI e acessado viaSistemas de busca e recuperação Entrez , aumentando ainda mais a capacidade do público de descobrir, ler e desenvolver seu conhecimento biomédico. [2]

O PubMed Central é diferente do PubMed . [3] PubMed Central é um arquivo digital gratuito de artigos completos, acessível a qualquer pessoa de qualquer lugar por meio de um navegador da web (com várias disposições para reutilização). Por outro lado, embora o PubMed seja um banco de dados pesquisável de citações e resumos biomédicos, o artigo em texto completo reside em outro lugar (impresso ou online, gratuito ou por trás de um acesso pago do assinante ).

Em dezembro de 2018 , o arquivo PMC continha mais de 5,2 milhões de artigos, [4] com contribuições vindas de editoras ou autores que depositaram seus manuscritos no repositório de acordo com a Política de Acesso Público do NIH . Dados anteriores mostram que de janeiro de 2013 a janeiro de 2014, os depósitos iniciados pelo autor excederam 103.000 papéis durante um período de 12 meses. [5] O PMC identifica cerca de 4.000 periódicos que participam de alguma forma para depositar seu conteúdo publicado no repositório do PMC. [6]Alguns editores atrasam o lançamento de seus artigos no PubMed Central por um determinado período de tempo após a publicação, denominado "período de embargo", que varia de alguns meses a alguns anos, dependendo do periódico. (Embargos de seis a doze meses são os mais comuns.) PubMed Central é um exemplo chave de "distribuição externa sistemática por terceiros", [7] que ainda é proibida pelos acordos de contribuição de muitas editoras.

Adoção [ editar ]

Lançado em fevereiro de 2000, o repositório cresceu rapidamente à medida que a Política de Acesso Público do NIH foi projetada para tornar todas as pesquisas financiadas pelo National Institutes of Health (NIH) gratuitamente acessíveis a qualquer pessoa e, além disso, muitos editores estão trabalhando em cooperação com o NIH para fornecer acesso gratuito às suas obras. No final de 2007, o Consolidated Appropriations Act de 2008 (HR 2764) foi sancionado e incluiu uma disposição exigindo que o NIH modificasse suas políticas e exigisse a inclusão no PubMed Central de cópias eletrônicas completas de suas pesquisas revisadas por pares e descobertas financiadas pelo NIH pesquisar. Esses artigos devem ser incluídos no prazo de 12 meses após a publicação. Esta é a primeira vez que o governo dos EUA exige que uma agência forneça acesso abertopara pesquisar e é uma evolução da política de 2005, na qual o NIH pediu aos pesquisadores que adicionassem voluntariamente suas pesquisas ao PubMed Central. [8]

Uma versão do sistema PubMed Central do Reino Unido , UK PubMed Central (UKPMC) , foi desenvolvida pelo Wellcome Trust e pela Biblioteca Britânica como parte de um grupo de nove financiadores de pesquisa do Reino Unido. Este sistema entrou no ar em janeiro de 2007. Em 1 de novembro de 2012, tornou-se Europe PubMed Central . O membro canadense da rede PubMed Central International, PubMed Central Canada , foi lançado em outubro de 2009.

A linguagem de marcação de artigos de periódicos da National Library of Medicine "NLM Journal Publishing Tag Set" está disponível gratuitamente. [9] A Association of Learned and Professional Society Publishers comenta que "é provável que se torne o padrão para a preparação de conteúdo acadêmico para livros e periódicos". [10] Um DTD relacionado está disponível para livros. [11] A Biblioteca do Congresso e a Biblioteca Britânica anunciaram o suporte para o DTD NLM. [12] Também foi popular entre os provedores de serviços de periódicos. [13]

Com o lançamento de planos de acesso público para muitas agências além do NIH, o PMC está se tornando o repositório de uma variedade maior de artigos. [14] Isso inclui o conteúdo da NASA, com a interface marcada como "PubSpace". [15] [16]

Tecnologia [ editar ]

Os artigos são enviados ao PubMed Central por editores em XML ou SGML , usando uma variedade de DTDs de artigos . Editores maiores e mais antigos podem ter seus próprios DTDs internos, mas muitos editores usam o DTD de Publicação de Jornal NLM (veja acima).

Os artigos recebidos são convertidos via XSLT para o NLM Archiving and Interchange DTD muito semelhante. Este processo pode revelar erros que são reportados ao editor para correção. Os gráficos também são convertidos em formatos e tamanhos padrão. Os formulários originais e convertidos são arquivados. O formulário convertido é movido para um banco de dados relacional, junto com arquivos associados para gráficos, multimídia ou outros dados associados. Muitos editores também fornecem o PDF de seus artigos, que são disponibilizados sem alterações. [17]

As citações bibliográficas são analisadas e automaticamente vinculadas aos resumos relevantes no PubMed, artigos no PubMed Central e recursos em sites de editores. Os links do PubMed também levam ao PubMed Central. Referências não resolvidas, como periódicos ou artigos específicos ainda não disponíveis em uma dessas fontes, são rastreadas no banco de dados e "entram em ação" automaticamente quando os recursos se tornam disponíveis.

Um sistema de indexação interno fornece capacidade de pesquisa e está ciente da terminologia biológica e médica , como nomes de medicamentos genéricos vs. proprietários e nomes alternativos para organismos, doenças e partes anatômicas.

Quando um usuário acessa um fascículo de jornal, um índice é gerado automaticamente recuperando todos os artigos, cartas, editoriais, etc. desse fascículo. Quando um item real, como um artigo, é acessado, o PubMed Central converte a marcação NLM em HTML para entrega e fornece links para objetos de dados relacionados. Isso é viável porque a variedade de dados recebidos foi primeiro convertida para DTDs padrão e formatos gráficos.

Em um fluxo de submissão separado, os autores financiados pelo NIH podem depositar artigos no PubMed Central usando o NIH Manuscript Submission (NIHMS). Os artigos assim submetidos normalmente passam pela marcação XML para serem convertidos em DTD NLM.

Recepção [ editar ]

As reações ao PubMed Central entre a comunidade editorial acadêmica variam entre um entusiasmo genuíno de alguns, [18] e uma preocupação cautelosa de outros. [19]

Embora o PMC seja um parceiro bem-vindo para publicadores de acesso aberto em sua capacidade de aumentar a descoberta e disseminação do conhecimento biomédico, essa mesma verdade faz com que outros se preocupem com o tráfego sendo desviado da versão publicada do registro , as consequências econômicas de menos leitores, também como o efeito na manutenção de uma comunidade de acadêmicos nas sociedades científicas. [20] [21] Uma análise de 2013 encontrou fortes evidências de que os repositórios públicos de artigos publicados eram responsáveis ​​por "afastar um número significativo de leitores dos sites de periódicos" e que "o efeito do PMC está crescendo ao longo do tempo". [22]

Bibliotecas, universidades, apoiadores de acesso aberto, grupos de defesa da saúde do consumidor e organizações de direitos dos pacientes aplaudiram o PubMed Central e esperam ver repositórios de acesso público semelhantes desenvolvidos por outras agências de financiamento federais para compartilhar livremente quaisquer publicações de pesquisa que foram o resultado do apoio do contribuinte . [23]

O estudo Antelman sobre publicação de acesso aberto descobriu que em filosofia, ciência política, engenharia elétrica e eletrônica e matemática, artigos de acesso aberto tiveram um impacto maior de pesquisa. [24] Um ensaio randomizado encontrou um aumento nos downloads de conteúdo de artigos de acesso aberto, sem vantagem de citação sobre o acesso por assinatura um ano após a publicação. [25]

A política do NIH e o trabalho do repositório de acesso aberto inspiraram uma diretriz presidencial de 2013, que também estimulou ações em outras agências federais.

Em março de 2020, o PubMed Central acelerou seus procedimentos de depósito para o texto completo de publicações sobre coronavírus . O NLM fez isso a pedido do Escritório de Política Científica e Tecnológica da Casa Branca e de cientistas internacionais para melhorar o acesso de cientistas, provedores de saúde, inovadores de mineração de dados , pesquisadores de IA da saúde e o público em geral. [26]

PMCID [ editar ]

O PMCID (identificador PubMed Central), também conhecido como número de referência PMC, é um identificador bibliográfico para o banco de dados PubMed Central, assim como o PMID é o identificador bibliográfico para o banco de dados PubMed . Os dois identificadores são distintos, no entanto. Consiste em "PMC" seguido por uma sequência de sete números. O formato é: [27]

  • PMCID: PMC1852221

Os autores que se candidatam a prêmios NIH devem incluir o PMCID em sua inscrição.

Veja também [ editar ]

Referências [ editar ]

  1. ^ Beck J (2010). "Report from the Field: PubMed Central, an XML-based Archive of Life Sciences Journal Articles". Proceedings of the International Symposium on XML for the Long Haul: Issues in the long term Preservation of XML . 6 . doi : 10.4242 / BalisageVol6.Beck01 . ISBN 978-1-935958-02-4.
  2. ^ Maloney C, Sequeira E, Kelly C, Orris R, Beck J (5 de dezembro de 2013). PubMed Central . Centro Nacional de Informações sobre Biotecnologia (EUA).
  3. ^ "MEDLINE, PubMed e PMC (PubMed Central): Como eles são diferentes?" . www.nlm.nih.gov . 9 de setembro de 2019.
  4. ^ "Openness by Default", Inside Higher Ed , 16 de janeiro de 2017.
  5. ^ "Estatísticas NIHMS" . nihms.nih.gov .
  6. ^ "Home - PMC - NCBI" . www.ncbi.nlm.nih.gov .
  7. ^ Ouerfelli N. "Direitos do autor: o que é tudo sobre" (PDF) .
  8. ^ "Acesso público à lei de pesquisa do NIH" . Science Codex . 2007. Arquivado do original em 4 de março de 2016 . Retirado em 6 de novembro de 2013 .
  9. ^ "Conjunto de tags de publicação de periódicos" . Centro Nacional de Informações sobre Biotecnologia . Retirado em 6 de novembro de 2013 .
  10. ^ Francês D (4 de agosto de 2006). "Atualização da tecnologia ALPSP: um formato de documento XML padrão: o caso para a adoção do DTD NLM" . ALPSP . Retirado em 6 de novembro de 2013 .
  11. ^ "Conjunto de etiquetas de livro NCBI" . dtd.nlm.nih.gov .
  12. ^ "Notícias da Biblioteca do Congresso" . Biblioteca do Congresso . 19 de abril de 2006 . Retirado em 6 de novembro de 2013 .
  13. ^ "Inera Inc. - Recursos NLM DTD" . 19 de fevereiro de 2013. Arquivado do original em 19/02/2013.
  14. ^ "Planos de acesso público das agências federais dos EUA" . cendi.gov .
  15. ^ Kovo Y (22 de julho de 2016). "Acesso público aos resultados de pesquisas financiadas pela NASA" . nasa.gov . Arquivado do original em 19 de agosto de 2016.
  16. ^ "NASA em PMC" . preview.ncbi.nlm.nih.gov .
  17. ^ NLM Journal Archiving and Interchange Tag Suite , National Center for Biotechnical Information, National Library of Medicine
  18. ^ "PLOS Aplaude Congresso para Ação em Acesso Aberto" . Arquivado do original em 07/05/2016 . Página visitada em 07/02/2014 .
  19. ^ "Submissão da ACS ao Office of Science and Technology Policy Request for Information on Public Access to Peer-Revised Scholarly Publications Result from Federally Fined Research" (PDF) . Escritório de Política de Ciência e Tecnologia . Recuperado em 07/02/2014 - via Arquivos Nacionais .
  20. ^ Davis PM (outubro de 2012). “O efeito do depósito público de artigos científicos no público leitor”. O fisiologista . 55 (5): 161, 163-5. PMID 23155924 . 
  21. ^ Davis PM (julho de 2013). "Acessibilidade pública de artigos biomédicos do PubMed Central reduz o número de leitores de periódicos - análise de coorte retrospectiva" . FASEB Journal . 27 (7): 2536–41. doi : 10.1096 / fj.13-229922 . PMC 3688741 . PMID 23554455 .  
  22. ^ Davis PM (julho de 2013). "Acessibilidade pública de artigos biomédicos do PubMed Central reduz o número de leitores de periódicos - análise de coorte retrospectiva" . FASEB Journal . 27 (7): 2536–41. doi : 10.1096 / fj.13-229922 . PMC 3688741 . PMID 23554455 .  
  23. ^ "Autism Speaks anuncia nova política para dar às famílias acesso fácil e gratuito aos principais resultados da pesquisa - Comunicado à imprensa - Autism Speaks" . www.autismspeaks.org . 25 de julho de 2012.
  24. ^ Antelman, Kristin (2004). "Os artigos de acesso aberto têm um impacto maior na pesquisa?" . Bibliotecas universitárias e de pesquisa . 65 (5): 372–382. doi : 10.5860 / crl.65.5.372 ., resumido por Stemper J, Williams K (2006). "Comunicação científica: Transformando crise em oportunidade" . Notícias sobre bibliotecas universitárias e de pesquisa . 67 (11): 692–696. doi : 10.5860 / crln.67.11.7720 .
  25. ^ Davis PM, Lewenstein BV, Simon DH, cabine JG, Connolly MJ (julho de 2008). "Publicação em acesso aberto, downloads de artigos e citações: ensaio clínico randomizado" . BMJ . 337 : a568. doi : 10.1136 / bmj.a568 . PMC 2492576 . PMID 18669565 .  
  26. ^ "The National Library of Medicine expande o acesso à literatura sobre coronavírus por meio do PubMed Central" . National Institutes of Health (NIH) . 2020-03-25 . Recuperado em 2020-03-31 . Para apoiar essa iniciativa, o NLM está adaptando seus procedimentos padrão para depositar artigos no PMC para fornecer maior flexibilidade que garantirá que a pesquisa de coronavírus esteja prontamente disponível.
  27. ^ "Incluir PMCID nas citações | publicaccess.nih.gov" . publicaccess.nih.gov . Recuperado em 01-07-2017 .

Ligações externas [ editar ]