Relógio molecular

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O relógio molecular é um termo figurativo para uma técnica que usa a taxa de mutação de biomoléculas para deduzir o tempo na pré-história quando duas ou mais formas de vida divergiram . Os dados biomoleculares usados ​​para tais cálculos são geralmente sequências de nucleotídeos para DNA , RNA ou sequências de aminoácidos para proteínas . Os pontos de referência para determinar a taxa de mutação são freqüentemente datas fósseis ou arqueológicas. O relógio molecular foi testado pela primeira vez em 1962 nas variantes da proteína da hemoglobina de vários animais e é comumente usado emevolução molecular para estimar tempos de especiação ou radiação . Às vezes é chamado de relógio genético ou relógio evolutivo .

Descoberta precoce e equidistância genético

A noção da existência de um chamado "relógio molecular" foi atribuída pela primeira vez a Émile Zuckerkandl e Linus Pauling que, em 1962, notou que o número de diferenças de aminoácidos na hemoglobina entre as diferentes linhagens muda quase linearmente com o tempo, conforme estimado a partir de evidência fóssil. [1] Eles generalizaram esta observação para afirmar que a taxa de mudança evolutiva de qualquer proteína especificada era aproximadamente constante ao longo do tempo e em diferentes linhagens (conhecida como a hipótese do relógio molecular ).

O fenômeno de equidistância genética foi observado pela primeira vez em 1963 por Emanuel Margoliash , que escreveu: "Parece que o número de diferenças de resíduos entre o citocromo c de quaisquer duas espécies é principalmente condicionado pelo tempo decorrido desde as linhas de evolução que levaram a essas duas espécies originalmente divergiram. Se isso estiver correto, o citocromo c de todos os mamíferos deve ser igualmente diferente do citocromo c de todas as aves. Como os peixes divergem do tronco principal da evolução dos vertebrados antes de pássaros ou mamíferos, o citocromo c de mamíferos e aves deve ser igualmente diferente do citocromo c de peixes. Da mesma forma, todos os citocromos de vertebrados devem ser igualmente diferentes da proteína de levedura. " [2]Por exemplo, a diferença entre o citocromo c de uma carpa e uma rã, tartaruga, galinha, coelho e cavalo é de 13% a 14% muito constante. Da mesma forma, a diferença entre o citocromo c de uma bactéria e levedura, trigo, traça, atum, pombo e cavalo varia de 64% a 69%. Junto com o trabalho de Emile Zuckerkandl e Linus Pauling, o resultado da equidistância genética levou diretamente à postulação formal da hipótese do relógio molecular no início dos anos 1960. [3]

Da mesma forma, Vincent Sarich e Allan Wilson em 1967 demonstraram que as diferenças moleculares entre os primatas modernos nas proteínas da albumina mostraram que taxas aproximadamente constantes de mudança ocorreram em todas as linhagens que eles avaliaram. [4]A lógica básica de sua análise envolveu o reconhecimento de que se uma linhagem de espécie tivesse evoluído mais rapidamente do que uma linhagem de espécie irmã desde seu ancestral comum, então as diferenças moleculares entre uma espécie de grupo externo (mais distante) e as espécies de evolução mais rápida deveriam ser maiores ( já que mais mudanças moleculares teriam se acumulado nessa linhagem) do que as diferenças moleculares entre as espécies do grupo externo e as espécies de evolução mais lenta. Este método é conhecido como teste de taxa relativa . O artigo de Sarich e Wilson relatou, por exemplo, que reações cruzadas imunológicas de albumina humana ( Homo sapiens ) e chimpanzé ( Pan troglodytes ) sugeriram que eram quase igualmente diferentes de Ceboidea(Macaco do Novo Mundo) espécies (dentro do erro experimental). Isso significava que ambos haviam acumulado mudanças aproximadamente iguais na albumina desde seu ancestral comum. Esse padrão também foi encontrado para todas as comparações de primatas que eles testaram. Quando calibrado com os poucos pontos de ramificação fóssil bem documentados (como nenhum fóssil de primata de aspecto moderno encontrado antes da fronteira KT ), isso levou Sarich e Wilson a argumentar que a divergência humano-chimpanzé provavelmente ocorreu apenas ~ 4-6 milhões de anos atrás . [5]

Relacionamento com a teoria neutra

A observação de uma taxa de mudança molecular semelhante a um relógio era originalmente puramente fenomenológica . Posteriormente, o trabalho de Motoo Kimura [6] desenvolveu a teoria neutra da evolução molecular , que previa um relógio molecular. Sejam N indivíduos e, para manter esse cálculo simples, sejam os indivíduos haplóides (ou seja, tenham uma cópia de cada gene). Deixe que a taxa de mutações neutras (ou seja, mutações sem efeito na aptidão ) em um novo indivíduo seja. A probabilidade de que essa nova mutação se fixe na população é então 1 / N, uma vez que cada cópia do gene é tão boa quanto qualquer outra. Cada geração, cada indivíduo pode ter novas mutações, então háN novas mutações neutras na população como um todo. Isso significa que cada geração,novas mutações neutras serão corrigidas. Se a maioria das mudanças vistas durante a evolução molecular são neutras, então as fixações em uma população irão se acumular a uma taxa de relógio que é igual à taxa de mutações neutras em um indivíduo.

Calibração

O relógio molecular sozinho pode dizer que um período de tempo é duas vezes mais longo que outro: ele não pode atribuir datas concretas. Para filogenética viral e estudos de DNA antigo - duas áreas da biologia evolutiva onde é possível amostrar sequências ao longo de uma escala de tempo evolutiva - as datas das amostras intermediárias podem ser usadas para calibrar com mais precisão o relógio molecular. No entanto, a maioria das filogenias exige que o relógio molecular seja calibrado com base em evidências independentes sobre datas, como o registro fóssil . [7] Existem dois métodos gerais para calibrar o relógio molecular usando dados fósseis: calibração do nó e calibração da ponta. [8]

Calibração nó

Às vezes referido como datação de nó, calibração de nó é um método para calibração de filogenia que é feito colocando restrições fósseis em nós. Um fóssil de calibração de nó é o representante mais antigo descoberto desse clado , que é usado para restringir sua idade mínima. Devido à natureza fragmentária do registro fóssil, o verdadeiro ancestral comum mais recente de um clado provavelmente nunca será encontrado. [8] Para levar isso em consideração nas análises de calibração dos nós, uma idade máxima do clado deve ser estimada. Determinar a idade máxima do clado é desafiador porque se baseia em evidências negativas - a ausência de fósseis mais antigos nesse clado. Existem vários métodos para derivar a idade máxima do clado usando modelos de nascimento-morte, fósseisanálises de distribuição estratigráfica ou controles tafonômicos . [9] Alternativamente, em vez de um máximo e um mínimo, uma probabilidade prévia do tempo de divergência pode ser estabelecida e usada para calibrar o relógio. Existem várias distribuições de probabilidade anteriores, incluindo normal , lognormal , exponencial , gama , uniforme , etc.) que podem ser usadas para expressar a probabilidade da verdadeira idade de divergência em relação à idade do fóssil; [10] no entanto, existem poucos métodos para estimar a forma e os parâmetros da distribuição de probabilidade empiricamente. [11] A colocação dos nós de calibração na árvore informa a colocação dos nós irrestritos, dando estimativas de datas de divergência ao longo da filogenia. Métodos históricos de calibração de relógio só poderiam fazer uso de uma única restrição fóssil (suavização de taxa não paramétrica), [12] enquanto análises modernas ( BEAST [13] e r8s [14] ) permitem o uso de fósseis múltiplos para calibrar o molecular relógio. Estudos de simulação mostraram que aumentar o número de restrições fósseis aumenta a precisão da estimativa do tempo de divergência. [15]

Calibração da ponta

Às vezes chamada de datação de pontas , a calibração de pontas é um método de calibração de relógio molecular em que os fósseis são tratados como táxons e colocados nas pontas da árvore. Isso é obtido através da criação de uma matriz que inclui um conjunto de dados moleculares para os táxons existentes, juntamente com um conjunto de dados morfológicos para os táxons extintos e existentes. [9] Ao contrário da calibração do nó, este método reconstrói a topologia da árvore e coloca os fósseis simultaneamente. Modelos moleculares e morfológicos trabalham juntos simultaneamente, permitindo que a morfologia informe a localização dos fósseis. [8]A calibração da ponta faz uso de todos os táxons fósseis relevantes durante a calibração do relógio, em vez de depender apenas do fóssil mais antigo de cada clado. Este método não se baseia na interpretação de evidências negativas para inferir as idades máximas dos clados. [9]

Total de evidências namoro

Esta abordagem para calibração da ponta vai um passo adiante, estimando simultaneamente a localização dos fósseis, a topologia e a escala de tempo evolutiva. Nesse método, a idade de um fóssil pode informar sua posição filogenética além da morfologia. Ao permitir que todos os aspectos da reconstrução da árvore ocorram simultaneamente, o risco de resultados tendenciosos é reduzido. [8] Esta abordagem foi aprimorada combinando-a com diferentes modelos. Um método atual de calibração do relógio molecular é a datação de evidências totais emparelhada com o modelo fossilizado de nascimento-morte (FBD) e um modelo de evolução morfológica. [16] O modelo FBD é novo na medida em que permite "ancestrais amostrados", que são táxons fósseis que são ancestrais diretos de um táxon ou linhagem viva. Isso permite que os fósseis sejam colocados em um galho acima de um organismo existente, em vez de ficarem confinados às pontas. [17]

Métodos

Os métodos bayesianos podem fornecer estimativas mais adequadas dos tempos de divergência, especialmente se grandes conjuntos de dados - como aqueles produzidos pela filogenômica - forem empregados. [18]

Taxa n constante de relógio molecular

Às vezes, apenas uma única data de divergência pode ser estimada a partir dos fósseis, com todas as outras datas inferidas disso. Outros conjuntos de espécies possuem fósseis abundantes, permitindo testar a hipótese de taxas de divergência constantes. Sequências de DNA experimentando baixos níveis de seleção negativa mostraram taxas de divergência de 0,7–0,8% por  Myr em bactérias, mamíferos, invertebrados e plantas. [19] No mesmo estudo, as regiões genômicas que experimentaram uma seleção muito negativa ou purificadora (codificando rRNA) foram consideravelmente mais lentas (1% por 50 Myr).

Além dessa variação na taxa com a posição genômica, desde o início da década de 1990, a variação entre os táxons provou ser um terreno fértil para pesquisas também, [20] mesmo em períodos comparativamente curtos de tempo evolutivo (por exemplo, pássaros tímidos [21] ). Aves marinhas com nariz tubular têm relógios moleculares que, em média, funcionam à metade da velocidade de muitas outras aves, [22] possivelmente devido ao longo tempo de geração , e muitas tartarugas têm um relógio molecular funcionando a um oitavo da velocidade que em pequenos mamíferos, ou ainda mais lento. [23] Os efeitos do pequeno tamanho da população também podem confundir as análises do relógio molecular. Pesquisadores como Francisco J. Ayaladesafiaram mais fundamentalmente a hipótese do relógio molecular. [24] [25] [26] De acordo com o estudo de Ayala de 1999, cinco fatores se combinam para limitar a aplicação de modelos de relógio molecular:

  • Mudança dos tempos de geração (se a taxa de novas mutações depender, pelo menos em parte, do número de gerações, e não do número de anos)
  • Tamanho da população (a deriva genética é mais forte em pequenas populações e, portanto, mais mutações são efetivamente neutras)
  • Diferenças específicas de espécie (devido a diferentes metabolismo, ecologia, história evolutiva, ...)
  • Mudança na função da proteína estudada (pode ser evitada em espécies intimamente relacionadas, utilizando sequências de DNA não codificantes ou enfatizando mutações silenciosas )
  • Mudanças na intensidade da seleção natural.
Filograma mostrando três grupos, um dos quais tem ramos notavelmente mais longos que os outros
Bambus lenhosos (tribos Arundinarieae e Bambuseae ) têm tempos de geração longos e taxas de mutação mais baixas, conforme expresso por ramos curtos na árvore filogenética , do que os bambus herbáceos de evolução rápida ( Olyreae ).

Os usuários de relógios moleculares desenvolveram soluções alternativas usando uma série de abordagens estatísticas, incluindo técnicas de máxima verossimilhança e posterior modelagem bayesiana . Em particular, modelos que levam em consideração a variação da taxa entre as linhagens foram propostos a fim de obter melhores estimativas dos tempos de divergência. Esses modelos são chamados de relógios moleculares relaxados [27] porque representam uma posição intermediária entre a hipótese do relógio molecular "estrito" e o modelo de muitas taxas de Joseph Felsenstein [28] e são possíveis através do MCMCtécnicas que exploram uma gama ponderada de topologias de árvore e, simultaneamente, estimam parâmetros do modelo de substituição escolhido. Deve ser lembrado que as datas de divergência inferidas usando um relógio molecular são baseadas em inferência estatística e não em evidências diretas .

O relógio molecular enfrenta desafios específicos em escalas de tempo muito curtas e muito longas. Em escalas de tempo longas, o problema é a saturação . Quando já passou tempo suficiente, muitos sites passaram por mais de uma alteração, mas é impossível detectar mais de uma. Isso significa que o número observado de mudanças não é mais linear com o tempo, mas se achatou. Mesmo em distâncias genéticas intermediárias, com dados filogenéticos ainda suficientes para estimar a topologia, o sinal para a escala geral da árvore pode ser fraco em modelos de probabilidade complexos, levando a estimativas de relógio molecular altamente incertas. [29]

Em escalas de tempo muito curtas, muitas diferenças entre as amostras não representam a fixação de diferentes sequências nas diferentes populações. Em vez disso, eles representam alelos alternativos que estavam presentes como parte de um polimorfismo no ancestral comum. A inclusão de diferenças que ainda não foram corrigidas leva a uma inflação potencialmente dramática da taxa aparente do relógio molecular em escalas de tempo muito curtas. [30] [31]

Usos

A técnica do relógio molecular é uma ferramenta importante na sistemática molecular , o uso de informações da genética molecular para determinar a classificação científica correta dos organismos ou para estudar a variação nas forças seletivas. O conhecimento da taxa aproximadamente constante de evolução molecular em conjuntos específicos de linhagens também facilita a estimativa das datas de eventos filogenéticos , incluindo aqueles não documentados por fósseis , como as divergências entre táxons vivos . Nesses casos - especialmente em longos períodos de tempo - as limitações da hipótese do relógio molecular (acima) devem ser consideradas; essas estimativas podem estar 50% incorretas ou mais.

Veja também

Referências

  1. ^ Zuckerkandl, E. e Pauling, LB (1962). "Doença molecular, evolução e heterogeneidade gênica" . Em Kasha, M .; Pullman, B (eds.). Horizons in Bioquímica . Academic Press, New York. pp.  189–225 .CS1 maint: multiple names: authors list (link)
  2. ^ Margoliash E (outubro de 1963). "Estrutura primária e evolução do citocromo C" . Proc. Natl. Acad. Sci. EUA . 50 (4): 672–9. Bibcode : 1963PNAS ... 50..672M . doi : 10.1073 / pnas.50.4.672 . PMC 221244 . PMID 14077496 .  
  3. ^ Kumar S (agosto de 2005). "Relógios moleculares: quatro décadas de evolução". Nat. Rev. Genet . 6 (8): 654–62. doi : 10.1038 / nrg1659 . PMID 16136655 . S2CID 14261833 .  
  4. ^ Sarich, VM; Wilson, AC (julho de 1967). "Taxas de evolução da albumina em primatas" . Anais da Academia Nacional de Ciências dos Estados Unidos da América . 58 (1): 142–148. Bibcode : 1967PNAS ... 58..142S . doi : 10.1073 / pnas.58.1.142 . ISSN 0027-8424 . PMC 335609 . PMID 4962458 .   
  5. ^ Sarich, Vincent M .; Wilson, Allan C. (1967). "Escala de tempo imunológico para a evolução dos hominídeos". Ciência . 158 (3805): 1200-1203. Bibcode : 1967Sci ... 158.1200S . doi : 10.1126 / science.158.3805.1200 . JSTOR 1722843 . PMID 4964406 . S2CID 7349579 .   
  6. ^ Kimura, Motoo (1968). "Taxa evolutiva a nível molecular". Nature . 217 (5129): 624–626. Código Bib : 1968Natur.217..624K . doi : 10.1038 / 217624a0 . PMID 5637732 . S2CID 4161261 .  
  7. ^ Benton, MJ & Donoghue, PCJ (2007). "Evidências paleontológicas até a data da Árvore da Vida" . Molecular Biology & Evolution . 24 (1): 26–53. doi : 10.1093 / molbev / msl150 . PMID 17047029 . 
  8. ^ a b c d Donoghue, PCJ & Ziheng, Y. (2016). "A evolução dos métodos para estabelecer escalas de tempo evolutivas" . Phil. Trans. R. Soc. B . 371 (1): 20160020. doi : 10.1098 / rstb.2016.0020 . PMC 4920342 . PMID 27325838 .  
  9. ^ a b c O'Reilly, JE & Mario DR (2015). "Dicas de namoro para estimativa de tempo de divergência" (PDF) . Tendências em genética . 31 (11): 637–650. doi : 10.1016 / j.tig.2015.08.001 . hdl : 1983 / ba7bbcf4-1d51-4b74-a800-9948edb3bbe6 . PMID 26439502 .  
  10. ^ Drummond A, Suchard MA, Xie D, Rambaut A (2012). "Bayesian phylogenetics with BEAUti and the BEAST 1.7" . Biologia Molecular e Evolução . 29 (8): 1969–1973. doi : 10.1093 / molbev / mss075 . PMC 3408070 . PMID 22367748 .  
  11. ^ Claramunt, S .; Cracraft, J. (2015). "Uma nova árvore do tempo revela a marca da história da Terra na evolução dos pássaros modernos" . Sci Adv . 1 (11): e1501005. Bibcode : 2015SciA .... 1E1005C . doi : 10.1126 / sciadv.1501005 . PMC 4730849 . PMID 26824065 .  
  12. ^ Sanderson, M. (1997). "Uma abordagem não paramétrica para estimar tempos de divergência na ausência de constância de taxa" (PDF) . Biologia Molecular e Evolução . 14 (12): 1218–1231. doi : 10.1093 / oxfordjournals.molbev.a025731 . S2CID 17647010 . Arquivado do original (PDF) em 21 de abril de 2017.  
  13. ^ Drummond A, Suchard MA, Xie D, Rambaut A (2012). "Bayesian phylogenetics with BEAUti and the BEAST 1.7" . Biologia Molecular e Evolução . 29 (8): 1969–1973. doi : 10.1093 / molbev / mss075 . PMC 3408070 . PMID 22367748 .  
  14. ^ Sanderson, M. (2003). "r8s: inferindo taxas absolutas de evolução molecular e tempos de divergência na ausência de um relógio molecular" (PDF) . Bioinformática . 19 (2): 301–302. doi : 10.1093 / bioinformática / 19.2.301 . PMID 12538260 .  
  15. ^ Zheng Y. & Wiens JJ (2015). "Os dados perdidos influenciam a precisão da estimativa do tempo de divergência com o BEAST?". Molecular Phylogenetics and Evolution . 85 (1): 41–49. doi : 10.1016 / j.ympev.2015.02.002 . PMID 25681677 . 
  16. ^ Heath, TA & Huelsenbeck, JP (2014). "O processo fossilizado de nascimento-morte para calibração coerente de estimativas de divergência-tempo" . PNAS . 111 (29): E2957 – E2966. arXiv : 1310,2968 . Bibcode : 2014PNAS..111E2957H . doi : 10.1073 / pnas.1319091111 . PMC 4115571 . PMID 25009181 .  
  17. ^ Gavryushkina, A .; Heath, TA; Ksepka, DT; Stadler, T .; Welch, D. & Drummond, AJ (2016). "A datação bayesiana de evidências totais revela a recente radiação da coroa dos pinguins" . Biologia Sistemática . 66 (1): 1–17. arXiv : 1506.04797 . doi : 10.1093 / sysbio / syw060 . PMC 5410945 . PMID 28173531 .  
  18. ^ Dos Reis, M .; Inoue, J .; Hasegawa, M .; Asher, RJ; Donoghue, PCJ; Yang, Z. (2012). "Conjuntos de dados filogenômicos fornecem precisão e exatidão na estimativa da escala de tempo da filogenia placentária de mamíferos" . Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences . 279 (1742): 3491–3500. doi : 10.1098 / rspb.2012.0683 . PMC 3396900 . PMID 22628470 .  
  19. ^ Ochman H, Wilson AC (1987). "Evolução em bactérias: evidência de uma taxa de substituição universal em genomas celulares". J Mol Evol . 26 (1–2): 74–86. Bibcode : 1987JMolE..26 ... 74O . doi : 10.1007 / BF02111283 . PMID 3125340 . S2CID 8260277 .  
  20. ^ Douzery, EJP, Delsuc, F., Stanhope, MJ e Huchon, D. (2003). "Relógios moleculares locais em três genes nucleares: tempos de divergência para roedores e outros mamíferos e incompatibilidade entre calibrações fósseis" (PDF) . Journal of Molecular Evolution . 57 : S201 – S213. Bibcode : 2003JMolE..57S.201D . CiteSeerX 10.1.1.535.897 . doi : 10.1007 / s00239-003-0028-x . PMID 15008417 . S2CID 23887665 .    CS1 maint: multiple names: authors list (link)
  21. ^ Hunt, JS, Bermingham, E. e Ricklefs, RE (2001). "Sistemática molecular e biogeografia de thrashers, tremblers e mockingbirds das Antilhas (Aves: Mimidae)". Auk . 118 (1): 35–55. doi : 10.1642 / 0004-8038 (2001) 118 [0035: MSABOA] 2.0.CO; 2 . ISSN 0004-8038 . CS1 maint: multiple names: authors list (link)
  22. ^ Rheindt, FE & Austin, J. (2005). "Principais deficiências analíticas e conceituais em uma revisão taxonômica recente dos Procellariiformes - Uma resposta a Penhallurick e Wink (2004)" (PDF) . Emu . 105 (2): 181–186. doi : 10.1071 / MU04039 . S2CID 20390465 .  
  23. ^ Avise, JC, Bowen, W., Lamb, T., Meylan, AB e Bermingham, E. (1º de maio de 1992). "Evolução do DNA mitocondrial no ritmo de uma tartaruga: evidência de baixa variabilidade genética e taxa microevolutiva reduzida nos testículos" . Biologia Molecular e Evolução . 9 (3): 457–473. doi : 10.1093 / oxfordjournals.molbev.a040735 . PMID 1584014 . CS1 maint: multiple names: authors list (link)
  24. ^ Ayala, FJ (1999). "Miragens do relógio molecular" . BioEssays . 21 (1): 71–75. doi : 10.1002 / (SICI) 1521-1878 (199901) 21: 1 <71 :: AID-BIES9> 3.0.CO; 2-B . PMID 10070256 . Arquivado do original em 16 de dezembro de 2012. 
  25. ^ Schwartz, JH & Maresca, B. (2006). "Do Molecular Clocks Run at All? A Critique of Molecular Systematics". Teoria Biológica . 1 (4): 357–371. CiteSeerX 10.1.1.534.4502 . doi : 10.1162 / biot.2006.1.4.357 . S2CID 28166727 . Resumo de leigos - Science Daily .  
  26. ^ Pascual-García, A .; Arenas, M. e Bastolla, U. (2019). “O relógio molecular na evolução das estruturas das proteínas”. Biologia Sistemática . 68 (6): 987–1002. doi : 10.1093 / sysbio / syz022 . PMID 31111152 . Resumo da postura . 
  27. ^ Drummond, AJ, Ho, SYW, Phillips, MJ e Rambaut A. (2006). "Filogenética relaxada e encontros com confiança" . PLoS Biology . 4 (5): e88. doi : 10.1371 / journal.pbio.0040088 . PMC 1395354 . PMID 16683862 .  CS1 maint: multiple names: authors list (link) acesso livre
  28. ^ Felsenstein, J (2001). "Levando em consideração a variação das taxas evolutivas entre os locais na inferência de filogenias". J Mol Evol . 53 (4–5): 447–55. Bibcode : 2001JMolE..53..447F . doi : 10.1007 / s002390010234 . PMID 11675604 . S2CID 9791493 .  
  29. ^ Marshall, DC, e outros. 2016. Inflação de taxas de relógio molecular e datas: filogenética molecular, biogeografia e diversificação da radiação global de uma cigarra da Australásia (Hemiptera: Cicadidae: Cicadettini). Systematic Biology 65 (1): 16–34 .
  30. ^ Ho SY, Phillips MJ, Cooper A, Drummond AJ (2005). "Dependência do tempo das estimativas da taxa molecular e superestimação sistemática dos tempos de divergência recentes" . Molecular Biology & Evolution . 22 (7): 1561–1568. doi : 10.1093 / molbev / msi145 . PMID 15814826 . 
  31. ^ Peterson GI, Masel J (2009). "Predição quantitativa do relógio molecular e Ka / Ks em escalas de tempo curtas" . Molecular Biology & Evolution . 26 (11): 2595–2603. doi : 10.1093 / molbev / msp175 . PMC 2912466 . PMID 19661199 .  

Outras leituras

Ligações externas