SARS-CoV-2デルタバリアント

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SARS-CoV-2バリアント
デルタ
SARS-CoV-2の外部構造の科学的に正確な原子モデル。 それぞれの「ボール」は原子です。
一般的な詳細
WHO指定デルタ
系統B.1.617.2
最初に検出されたインド
報告日2020 ; 2年前 (2020)
スターテス懸念される変異株
症状
ケースマップ
2021年8月10日時点でデルタ変異の症例が確認されている国(GISAID)[更新が必要]
凡例:
  10,000以上の確認済みシーケンス
  5,000〜9,999の確認済みシーケンス
  1,000〜4,999の確認済みシーケンス
  100〜999の確認済みシーケンス
  10〜99の確認済みシーケンス
  1〜9の確認済みシーケンス
  データなしまたはデータなし
SARS-CoV-2バリアント

デルタバリアント(B.1.617.2)は、COVID-19を引き起こすウイルスであるSARS-CoV-2のバリアントです2020年後半にインドで最初に検出されました。デルタバリアントは2021年5月31日に命名され、2021年11月22日までに179か国以上に広がりました。世界保健機関(WHO)は、2021年6月にデルタバリアントが優勢になりつつあることを示しました。グローバルに緊張します。[3]

SARS-CoV-2スパイクタンパク質をコードする遺伝子に変異があり[4]、ウイルスの伝染性や中和できるかどうかに影響を与えることが知られているT478K、 P681RL452R置換[5] [6]を引き起こします。 COVID-19ウイルスの以前に循環している変異体に対する抗体による。[7]これは既知の最も伝染性の高い呼吸器ウイルスの1つであると考えられています。[8] 2021年8月、英国公衆衛生サービス(PHE)は、デルタの非旅行または未知の症例の家庭内接触における二次発病率が、アルファ変異体の10.2%に対して10.8%であると報告しました。; [9]デルタの386,835人の致死率は0.3%であり、症例の46%と死亡の6%はワクチン未接種で50歳未満です。[10] 以前の回復からの免疫[11] [12]またはCOVID-19ワクチンは、亜種による感染による重度の疾患または入院を防ぐのに効果的です。[13]

2021年5月7日、PHEは、B.1.1.7( Alpha)と少なくとも同等の伝染性の評価に基づいて、系統B.1.617.2の分類を調査中のバリアント(VUI)から懸念のあるバリアント(VOC)に変更しました。バリアント); [14] 5月のデータを使用した英国のSAGEは、50%感染率が高いという「現実的な」可能性を推定しました。[15] 2021年5月11日、WHOはこの系統のVOCも分類し、より高い透過率と中和の低下の証拠を示したと述べた。2021年6月15日、米国疾病予防管理センター(CDC)は、デルタを懸念の変種と宣言しました。[16]

この亜種は、2021年2月に始まったインドのパンデミックの致命的な第2波の原因の一部であると考えられています。 [17] [18] [19]その後、イギリスのフィジー第3波に寄与しました[20] [21] [ 22]および南アフリカ[23]およびWHOは、 2021年7月に、ヨーロッパおよびアフリカの他の場所でも同様の影響を与える可能性があると警告しました[24] [23] 7月下旬までに、アジアの一部で毎日の感染が増加し[25]米国[26] オーストラリア、およびニュージーランド[27]さらに別のCOVIDバリアントであるオミクロンが続いた。

分類

デルタ変異体は、SARS-CoV-2スパイクタンパク質をコードする遺伝子に変異があり[4] 、D614G、 T478K、P681R、L452R置換引き起こします。[28] [6] Nextstrain系統分類システムでは、21A、21I、および21Jクレードとして識別されます。[29]

名前

このウイルスは、もともとインドで検出されたため、「インドの亜種」[30]という用語でも呼ばれています。ただし、デルタバリアントは、系統B.1.617の3つのバリアントのうちの1つにすぎず、すべてがインドで最初に検出されました。[31] 2021年5月末、WHOは、懸念のある変異株および関心のある変異株にギリシャ文字を使用するという新しい方針を導入した後、ラベルDeltaを系統B.1.617.2に割り当てました。[32]

B.1.617の他の亜系統

これまでに分類された系統B.1.617には3つの亜系統があります。

B.1.617.1(カッパバリアント)は、英国公衆衛生サービスによって2021年4月に調査中のバリアントに指定されました2021年4月の後半に、他の2つのバリアントB.1.617.2とB.1.617.3が調査中のバリアントとして指定されました。B.1.617.3はB.1.617.1で見つかったL452RおよびE484Q変異を共有していますが、B.1.617.2にはE484Q変異がありません。B.1.617.2にはT478K変異がありますが、B.1.617.1およびB.1.617.3にはありません。[33] [34]同時に、ECDCは、B.1.617の3つのサブリネージすべてをVOIとして維持する概要を発表し、「現在の対策を変更する前に、これらのB.1.617リネージに関連するリスクをより深く理解する必要がある」と推定しました。考慮"。[35]

突然変異


SARS-CoV-2デルタ変異体における変異の定義
遺伝子 ヌクレオチド アミノ酸
ORF1b P314L
P1000L
スパイク G142D
T19R
R158G
L452R
T478K
D614G
P681R
D950N
E156del
F157del
M I82T
N D63G
R203M
D377Y
ORF3a S26L
ORF7a V82A
T120I
出典:CDC [37] Covariants.org [38]

Delta / B.1.617.2ゲノムには、それがコードするタンパク質のアミノ酸配列に変化をもたらす13の突然変異(いくつかの情報源によると15または17、より一般的な突然変異が含まれるかどうによって異なります)があります。[39]

スパイクタンパク質変異のリストは、19R、(G142D)、Δ156-157、R158G、L452R、T478K、D614G、P681R、GVNによるD950N、[40]またはT19R、G142D、del 156-157、R158G、L452R、 GenscriptによるT478K、D614G、P681R [41] これらのうちの4つは、すべてウイルスのスパイクタンパク質コードに含まれており、特に懸念されます。

E484Q変異はB.1.617.2ゲノムには存在しません。[45] [46]

系統

2021年8月の時点で、デルタバリアントは、パンゴ系統指定システムでAY.1からAY.28までのバリアントに細分されています。しかし、そのような分類がウイルスの生物学的特徴の変化と相関するかどうかについての情報はありません。[47] 2021年8月の時点で、AY.4からAY.11が英国で優勢であり、AY.12がイスラエルで、AY.2、AY.3、AY.13、AY.14、AYであると言われています。米国で25、米国とメキシコでAY.20、カナダでAY.15、ケニアでAY.16、アイルランドと北アイルランドでAY.17、南アフリカでAY.19、イタリアとスイスでAY.21、ポルトガルでAY.22、インドネシアでAY.24、インドネシア、シンガポール、日本、韓国でAY.23。[48]

「デルタプラス」バリアント

K417Nを伴うデルタは、もともと系統AY.1およびAY.2に対応し[49]、その後系統AY.3、[50]にも対応し、 「デルタプラス」または「ネパールバリアント」と呼ばれています。[51] K417N変異があり、[52]ベータバリアントにも存在します。[53]位置417での交換は、リジンからアスパラギンへの置換である。[54]

2021年10月中旬の時点で、AY.3バリアントは、米国では約5%、世界では2%の累積有病率を占めています。[55] 10月中旬、AY.4.2デルタ亜系統はイギリスで拡大し、監視および評価されていた。スパイクタンパク質に変異A222VとY145Hが含まれています[56]。特に懸念されることはありません。AY.4.2は、元のDeltaバリアントよりも10〜15%伝達率が高い可能性があることが示唆されています。2021年10月中旬、AY.4.2は症例の推定10%を占め、5日程度の世代時間あたり約1%(10%の10%)に上昇する追加の成長率をもたらしました。この追加の成長率は、有病率の増加とともに増加します。AY.4.2がなく、他に変更がなければ、英国での症例数は約10%少なくなります。[57] AY.4.2は週に約15%速く成長します。[58]英国では、2021年10月下旬に「調査中の変異体」(「懸念」ではない)として再分類された。[59]デンマークでは、AY.4.2の症例が減少した後、新たな急速な急増が検出および監視されましたが、まだ懸念の原因とは見なされていませんでした。[60] [61]

症状

最も一般的な症状は、以前は標準的なCOVID-19に関連していた最も一般的な症状から変化している可能性があります。感染した人は、症状をひどい風邪と間違え、隔離する必要があることに気付かない可能性があります。報告されている一般的な症状は、頭痛、喉の痛み、鼻水、または発熱です。[1] [要出典] [2]英国では、デルタ変異が新規症例の91%を占めたとき、ある研究では、最も報告された症状は頭痛、喉の痛み、鼻水であることがわかりました。[62]

防止

デルタに対するワクチン保護の要約
WHOの更新、2021年8月24日[63]
病気や感染症 重度:保護が保持されている
症状:保護が低下している可能性がある
重度の病気 安定AstraZeneca-Vaxzevria(1)、Moderna(1)、Pfizer-BioNTech(2)
対症療法 安定to 中立的な減少:ファイザー-BioNTech(3)
中立的な減少コヴァクシン(1)
中立的な減少中立的な減少:アストラゼネカ-Vaxzevria(2)
感染 中立的な減少:AstraZeneca-Vaxzevria(1)、Pfizer-BioNTech(1)
記号は、ワクチン有効性(VE)の低下の大きさを示しています。VEの削減は、保護の喪失を意味するものではないことに注意してください。元の高い保護率(95%など)とある程度の削減(10%など)でも保護(85%など)が維持されるためです。括弧で囲まれているのは、適応症を支持する研究の数です。研究は、母集団、結果の定義、研究デザインなどが異なり、異なる研究における製品のVE推定値の違いを説明する可能性があります。また、削減はVEの推定値を表しており、研究間で大幅に異なる可能性のある推定値に関する不確実性を表すものではありません。VEの削減は、これらの制限付きで解釈する必要があります。

安定:VEは<10%減少するか、コンパレータなしでVE> 90%
中立的な減少減少します:VEは10から<20%の間で減少します

中立的な減少中立的な減少:VEは20〜 <30%減少します
中和への影響(完全ワクチン接種)[64]
安定to 中立的な減少Anhui-ZIFIVAX(2)、Covaxin(3)
中立的な減少Janssen(3)、Moderna(3)、Covishield(2)
中立的な減少to 中立的な減少中立的な減少AstraZeneca-Vaxzevria(4)、Pfizer-BioNTech(8)
中立的な減少中立的な減少:Moderna&Pfizer-BioNTech( 1)*
中立的な減少から中立的な減少中立的な減少中立的な減少Coronavac(2)
記号は、完全ワクチン接種による中和の減少の大きさを示しています。括弧で囲まれているのは、適応症を支持する研究の数です。

安定:中和が2倍未満
中立的な減少減少:中和が2倍から5倍未満
中立的な減少中立的な減少減少:中和が5倍から10倍未満減少
中立的な減少中立的な減少中立的な減少:中和が10倍以上減少
* Moderna&Pfizer-BioNTechが一緒に評価されました。

WHOは特にデルタに対する予防措置を発行していません。野生型COVID-19を予防するために推奨される非医薬品対策は依然として有効であるはずです。これらには、手を洗う、マスクを着用する、他の人との距離を保つ、口、鼻、または目に触れないようにする、特に人々が話している場所で換気の悪い混雑した屋内スペースを避ける、症状が現れた場合はテストを受ける、病気。[65] 公衆衛生当局は、引き続き検査を使用して感染した個人を見つけ、その接触を追跡し、検査で陽性または曝露された人を隔離する必要があります。[66] イベント主催者は、大人数の集会の潜在的なリスクを評価し、これらのリスクを軽減するための計画を立てる必要があります。[67]非医薬品介入(疫学) も参照してください

ICMRは、COVID-19症例の回復期血清と、Bharat BiotechのBBV152(Covaxin)のレシピエントが有効低いもののVUIB.1.617を中和できることを発見しました。[68]

インスティテュート・オブ・ゲノミクス・アンド・インテグレーティブ・バイオロジー(IGIB)の所長であるアヌラグ・アグラワルは、系統B.1.617で利用可能なワクチンの有効性に関する研究は、ワクチン接種後の感染がより軽度であることを示唆していると述べた。[69]

米国大統領の最高医療顧問であるアンソニー・ファウチも、予備的な結果について自信を示しています。4月28日のインタビューで、彼は次のように述べています。

これは、私たちがまだ毎日データを取得しているものです。しかし、最新のデータは、COVID-19症例の回復期の血清と、インドで使用されているワクチンであるコバキシンを投与された人々を調べていました。617の亜種を中和することがわかった。[70]

ハイデラバードの細胞分子生物学センター(CCMB)による別の研究では、Covishield (Oxford–AstraZeneca)ワクチン接種血清が系統B.1.617に対する保護を提供することがわかりました[71]

英国公衆衛生サービスが実施した調査によると、ワクチンを接種していない人と比較して、ファイザー-バイオエヌテックまたはアストラゼネカ-オックスフォードのいずれかでワクチンを接種した人は、初回投与後に変異体によって引き起こされる症候性疾患の症例が33%少ないことがわかりました。ファイザー-バイオエヌテックワクチンの2回目の接種を受けてから2週間後の患者では、ワクチン未接種の患者と比較して、デルタ変異による症候性疾患の患者が88%少なくなりました。アストラゼネカ-オックスフォードワクチンの2回目の接種を受けてから2週間後の患者では、ワクチン未接種の被験者と比較して、デルタ変異による症候性疾患の被験者が60%少なくなりました。[72] [73]

TheLancetに掲載されたFrancisCrick Instituteの研究者グループによる研究によると、ファイザー-BioNTechワクチンで完全にワクチン接種されたヒトは、元の変異体と比較して、デルタ変異体に対する中和抗体のレベルが5倍以上低い可能性があります。 COVID-19株。[74] [75]

2021年6月、英国公衆衛生サービスは、2回の接種後、ファイザー-バイオエヌテックワクチンアストラゼネカワクチンがデルタ変異による入院の予防にそれぞれ96%と92%有効であるという調査を実施したと発表しました。[76] [77]

7月3日、カナダのオンタリオ州にあるトロント大学とオタワ大学の研究者は、ModernaワクチンがDeltaバリアントによる死亡または入院に対して有効である可能性があることを示唆するプレプリント研究を発表しました。[78] [信頼できない医療情報源?]

2021年7月のSriJayewardenepura大学の研究では、 Sinopharm BIBPワクチンワクチンが、両方の用量のワクチンを受けた研究対象の95%でセロコンバージョンを引き起こしたことがわかりました。割合は20〜39歳のグループ(98.9%)で高かったが、60歳以上のグループ(93.3%)ではわずかに低かった。中和抗体は、研究されたワクチン接種を受けた個人の81.25%に存在しました。[79] [80]

2021年6月29日、ガマレヤ研究所の所長であるDenis Logunovは、スプートニクVがデルタ変異体に対して約90%有効であると述べました。[81]

7月21日、英国公衆衛生サービスの研究者は、ファイザーワクチンが2回の投与後にデルタからの症候性疾患に対して93.7%有効であるのに対し、アストラゼネカワクチンは67%有効であるという研究を発表しました。[82]

8月2日、数人の専門家が、現在のワクチンで免疫された人々の間でデルタ変異体が感染するため、集団免疫を達成できない可能性があることへの懸念を表明しました。[83]

8月10日の研究では、完全なワクチン接種率は16か国でSARS-CoV-2デルタ変異変異頻度と逆相関していることが示されました(R-squared = 0.878)。データは、COVID-19に対する完全なワクチン接種がウイルスの進化を遅らせる可能性があることを強く示しています。[84]

処理

インビトロ実験は、バムラニビマブがそれ自体でデルタに対して効果的ではないかもしれないことを示唆している。[85] 十分に高い濃度でも、カシリビマブエテセビマブ、およびイムデビマブは依然として有効であるように思われる。プレプリント研究は、ソトロビマブがデルタに対しても有効である可能性があることを示唆しています。[86] シンガポールの医師は、以前の変種よりも多くのデルタ患者に酸素補給、レムデシビル、およびコルチコステロイドを使用している。[87]

疫学

デルタの影響の要約*
WHOの更新、2021年8月24日[63]
伝達率 感染率と二次発病率の増加、ワクチン接種を受けた個人とワクチン接種を受けていない個人の間の同様の感染率。
毒性 入院のリスクの増加
再感染 中和活性の低下
診断 影響はまだ報告されていません
* 査読されていない出版物を含む証拠に基づく、他の菌株と比較した一般化された所見。

伝達率

英国の科学者は、デルタ変異体は、英国で最初に同定された(ケント変異体として)以前は優勢だったアルファ変異体よりも40%から60%伝染性が高いと述べています。[88]アルファがすでに武漢2019年後半に出現した元のSARS-CoV-2株の150%伝達可能であることを考えると[88]、デルタがアルファの150%伝達可能である場合、デルタは225%になる可能性があります。元の菌株として伝染します。[89] BBCは次のように報告した –基本再生産数、またはすべての個人が感染しやすい集団の1つのケースによって直接生成される予想ケース数–最初に検出されたSARS-CoV-2ウイルスは2.4〜2.6であるのに対し、Alphaの再生産数は4〜5です。デルタは5〜9です。[90] [91]これらの基本再生産数は、MERS(0.29-0.80 [92])、季節性インフルエンザ(1.2-1.4 [93])、エボラ(1.4-1.8 [94])、風邪(2- 3 [95])、SARS(2–4 [96])、天然痘(3.5-6 [97])、および水痘(10-12 [98])。デルタの高い伝染性のために、ワクチン接種されたものでさえ脆弱です[99]が、程度は低いですが。[73]

Guangdong Provincial Center for Disease Control and Preventionによってオンラインで公開された研究[100]は、伝染性の増加を部分的に説明している可能性あります。パンデミックの初めに最初に特定された変異によって引き起こされる感染症。デルタに感染した人々がウイルスを検出できるようになるまでに平均4日かかりましたが、最初に特定された亜種では6日かかりました。[101] [102]

米国、ドイツ、オランダの監視データによると、デルタ型はアルファ型に比べて2週間ごとに約4倍に増加しています。[103] [104] [105]

インド、英国、[106]ポルトガル、[107]ロシア、[108]メキシコ、オーストラリア、インドネシア、[109]南アフリカ、ドイツ、[110]ルクセンブルグ、[111]米国、[ 112]オランダ、[113]デンマーク、[114]フランス[115]およびおそらく他の多くの国では、デルタバリアントが2021年7月までに優勢な系統になりました。国によっては、通常、症例間に数日から数週間の遅れがあります。およびバリアントレポート。7月20日の時点で、この亜種は124か国[64]WHOに広がっていました。まだではないにしても、それが支配的な株になりつつあることを示していた。[116]

オランダでは、2021年の28週以降、献血者の93.4%以上がSARS-CoV-2抗体陽性と検査され、ウイルスは依然として集団内で有意に増殖することができました。野生ウイルスへの曝露またはワクチンから開発されました。[117] [118]英国では、献血者および一般的なサーベイランスにおいて、同様の高い血清免疫レベルが発生しています。[119] [120] [121]

プレプリントによると、バリアントによる感染の最初の陽性テストでのウイルスは、2020年の感染と比較した場合よりも平均して約1000倍高かった。[122] [123] 5月から英国で10万人のボランティアを対象とした研究の予備データデルタが急速に広がっていた2021年7月まで、無症候性の症例を含め、COVID-19の検査で陽性となったワクチン接種を受けた人々は、平均してウイルス量が少ないことを示しています。米国、英国、およびシンガポールのデータによると、デルタに感染したワクチン接種を受けた人々は、ワクチン接種を受けていない感染者と同じくらい高いウイルス量を持っている可能性がありますが、より短い期間感染し続ける可能性があります。[124]

感染年齢層

インド政府の統合疾患サーベイランスプログラム(IDSP)のサーベイランスデータによると、入院患者と病院外の患者の約32%が、第1波では31%であったのに対し、第2波では30〜40歳でした。感染率は21%にとどまりました。20-39の範囲での入院は23.7%から25.5%に増加し、0-19の範囲は4.2%から5.8%に増加しました。データはまた、無症候性の患者のより高い割合が第2波の間に入院し、息切れのより多くの不満を示した。[125]

毒性

いくつかの初期の研究は、デルタ変異株が他の菌株よりも深刻な病気を引き起こすことを示唆しています。[126] 2021年6月7日、シンガポールの国立感染症センターの研究者は、デルタ陽性の患者は野生型またはアルファの患者よりも肺炎を発症する可能性が高く、および/または酸素を必要とする可能性が高いことを示唆する論文を投稿した。[127] 6月11日、英国公衆衛生サービスは、アルファと比較してデルタからの「入院のリスクが大幅に増加した」ことを発見した報告を発表した。[128]デルタ変異に感染した人のリスクは、約2倍高かった。[129] 6月14日、スコットランド公衆衛生の研究者デルタからの入院のリスクはアルファからのそれのおよそ2倍であることがわかりました。[130] 7月7日、トロント大学の疫学者によるプレプリント研究では、デルタの入院リスクが120%、または2倍以上、ICU入院のリスクが287%、 SARS-COV-2の非変異株と比較した死亡。[131]しかし、7月9日、英国公衆衛生サービスは、イングランドのデルタ変異が致死率を示したと報告した。(CFR)は0.2%であり、Alphaバリアントの致死率は1.9%でしたが、レポートでは、「パンデミックのさまざまな時点でピークに達したため、バックグラウンドの病院の圧力が異なるため、致死率はバリアント間で比較できません。 、ワクチン接種の利用可能性と率、症例プロファイル、治療オプション、報告遅延の影響などの要因があります。」[132]英国公衆衛生サービスのスポークスマンであるジェームズ・マクリーディーは、「他の変種と比較して致死率を評価するには時期尚早である」と明言した。[133]

2021年10月5日に発表されたカナダの研究では、デルタバリアントは、他のバリアントと比較して、入院が108%増加し、ICU入室が235%増加し、死亡が133%増加したことが明らかになりました。以前の亜種と比較して、より深刻で死亡のリスクが高くなり、免疫化によってオッズが大幅に低下します。[134] [135]

統計学

デルタ症例を検出する可能性は、特に国の配列決定率に応じて大幅に異なります(すべてのCOVID-19症例の0.05%未満が、最も低い配列決定国で最も高い配列決定された国で約50%になります)。[136] [137]

2021年6月22日までに、[更新が必要]約78か国で4,500を超えるバリアントのシーケンスが検出されました。[138] [139] [140]検出された国で報告されたシーケンスの数は次のとおりです。

国別の事例
国/地域 確認された症例(パンゴリン[141]
12月19日現在
確認された症例(GISAID[138]
11月23日現在

2022年1月19日現在の 症例(その他の情報源)
最初の検出 最後の検出
 イギリス 985,491 826,465 1,625,557 [142] 2021年2月22日
 アメリカ 1,099,811 947,472 症例の99.4%[143] 2021年2月23日
 カナダ 78,412 62,008 196,866 [144] 2021年3月15日
 ドイツ 150,416 117,513 2021年3月1日
 デンマーク 138,336 89,706 2021年3月8日
 日本 86,383 70,973 86,037 [145] [146] 2021年3月28日
 フランス 75,224 70,822 2021年2月21日
 七面鳥 54,134 50,578 5 [147] 2021年4月28日
 フィジー - 507 47,639 [148] [149] [150] 2021年4月19日
 インド 45,638 45,055 2020年10月5日
  スイス 48,304 38,003 2021年3月29日
 スウェーデン 46,018 37,773 2021年3月26日
 ベルギー 37,334 31,611 2021年3月25日
 イタリア 33,642 29,282 2021年4月2日
 スペイン 30,618 28,257 2021年4月22日
 オランダ 33,128 27,870 2021年4月6日
 オーストラリア 23,696 22,715 25,750 [151] 2021年3月16日
 アイルランド 22,425 21,061 2021年2月26日
 ブラジル 27,733 17,987 1051 [152] [153] 2021年5月20日[154] [155] [156] [157] [158]
 メキシコ 20,230 17,710 2021年4月5日
 スロベニア 16,334 13,439 2021年4月20日
 イスラエル 15,787 12,259 41 [159] [160] [161] 2021年4月16日
 ノルウェー 15,716 12,130 1 [162] 2021年4月15日
 ポルトガル 12,984 11,983 2021年4月5日
 南アフリカ 2,582 10,619 4 [163] 2021年4月30日
 ポーランド 16,484 10,320 16 [164] 2021年4月26日
 リトアニア 899 9,070 1 [165] 2021年6月17日
 フィンランド 1,570 8,733 2,876 [166] [167] [168] [169] 2021年3月18日
 チェコ共和国 11,225 8,487 2021年4月24日
 シンガポール 2,727 7,510 2021年2月26日
 スロバキア 353 7,146 2021年6月15日
 フィリピン 870 3,220 8,612 [170] [171] 2021年5月11日
 韓国 706 6,497 2021年3月26日
 クロアチア 479 6,165 2021年6月11日
 チリ 64 5,858 2021年6月13日
 ルクセンブルク 1,153 5,515 2021年4月15日
 インドネシア 1,623 4,980 2021年4月3日
 ルーマニア 294 4,655 2021年4月26日
 ブルガリア 231 4,614 2021年4月5日
 ロシア 1,468 4,295 16 [172] 2021年4月21日
 タイ 236 4,293 2 [173] 2021年4月24日
 アイスランド - 3,767 2021年8月30日
 マレーシア 146 3,624 2021年4月10日
 オーストリア 1,578 3,622 2021年4月17日
 ニュージーランド 92 2,844 107 [174] [175] 2021年3月9日
 エストニア - 2,740 2021年7月21日
 ギリシャ 17 2,642 2021年3月23日
 ペルー 6 2,580 2021年6月10日
 バーレーン 117 2,013 2021年4月5日
 ナイジェリア 36 1,795 1 [176] 2021年8月7日
 ケニア 256 1,700 5 [176] [177] 2021年7月17日
 アルバ 90 1,592 2021年4月16日
 ベトナム 54 1,414 12 [178] [179] 2021年4月18日
 プエルトリコ - 1,360 2021年9月9日
 カタール 121 1,343 2021年4月19日
 バングラデシュ 283 1,273 9 [180] [181] 2021年4月28日
 シントマールテン - 1,231 2021年3月19日
 エクアドル 89 1,023 2021年7月20日
 スリランカ 117 984 1 [182] 2021年4月30日
 コロンビア - 974 2021年7月3日
 ボツワナ 196 912 2 [183] 2021年4月28日
 ジブラルタル - 848 2021年9月5日
 コソボ - 834 2021年5月2日
 再会 54 754 2021年5月4日
 カンボジア 171 733 2021年4月5日
 パプアニューギニア - 717 2021年8月10日
 コスタリカ 35 689 2021年7月7日
 パキスタン 49 676 2021年5月16日
 中国 86 536 2021年4月24日
 モルディブ 6 525 2021年7月31日
 ガーナ 101 522 2021年4月20日
 キュラソー - 467 2021年4月23日
 ボネール - 458 2021年7月13日
 ボスニア・ヘルツェゴビナ 31 430 2021年7月26日
 エチオピア - 424 2021年8月16日
 セイシェル - 407 2021年9月30日
 アルゼンチン 4 385 2 [184] 2021年4月24日
 マルティニーク 8 365 2021年8月10日
 グアドループ - 362 2021年3月10日
 ヨルダン 5 360 2021年4月21日
 ウガンダ 134 340 1 [185] 2021年3月26日
 ザンビア 82 326 2021年5月29日
 ガンビア 42 316 2021年7月12日
 モザンビーク - 314 2021年7月16日
 グアテマラ 4 302 2021年7月29日
 ルワンダ 91 283 2021年7月9日
 カメルーン - 282 2021年9月28日
 ジョージア 19 272 2021年5月15日
 フランス領ギアナ 53 264 2021年7月22日
 アメリカ領バージン諸島 - 247 2021年8月18日
   ネパール 100 238 9 [186] 2021年4月28日
 コンゴ民主共和国 19 228 5 [176] 2021年5月3日
 マラウイ 5 213 2021年4月30日
 クウェート 108 191 2021年6月5日
 モンテネグロ - 178 2021年8月8日
 ウクライナ 13 170 2021年6月24日
 カザフスタン - 167 2021年8月19日
 オマーン 8 159 2021年5月17日
 アンゴラ 6 159 2021年1月14日
 香港 153 10 2021年4月22日
 スリナム - 150 2021年8月3日
 モロッコ 3 138 2 [187] 2021年5月3日
 トーゴ - 130 2021年7月31日
 トリニダード・トバゴ - 114 2021年8月3日
 ナミビア - 110 2021年6月
 パラグアイ 4 100 2021年7月8日
 ベリーズ - 98 2021年6月30日
 エジプト - 98 2021年7月15日
 ジンバブエ - 96 2021年7月26日
 リヒテンシュタイン - 95 2021年7月15日
 セネガル 13 93 2021年5月6日
 コンゴ共和国 - 87 2021年7月15日
 ヴェストラ・イェタランド - 86 2021年7月19日
 エスワティニ - 81 2021年7月26日
 レバノン - 80 2021年7月3日
 ラトビア 22 73 2021年5月27日
 モナコ 34 70 2021年5月15日
 モーリシャス 15 67 2021年5月8日
 マルタ 42 63 2021年6月23日
 ギニアビサウ - 62 2021年11月3日
 ブルンジ 3 57 2021年5月31日
 アンティグアバーブーダ - 57 2021年8月6日
 リベリア - 56 2021年7月10日
 アルメニア - 50 2021年8月5日
 ウズベキスタン 30 47 (未報告の数)[188] 2021年6月25日
 ベナン - 47 2021年7月23日
 北マケドニア 6 38 2021年7月11日
 バハマ - 38 2021年8月8日
 ケイマン諸島 - 37 2021年7月30日
 ミャンマー 12 33 2021年6月1日
 セルビア 5 33 2021年7月6日
 東ティモール - 33 12 [189] 2021年8月8日
 南スーダン - 29 2021年6月7日
 アラブ首長国連邦 - 28 2021年6月23日
 ブルネイ - 28 2021年8月17日
 ガボン - 27 2021年8月2日
 マヨット - 27 2021年10月21日
 アルジェリア 17 25 6 [190] 2021年7月28日
 アンドラ - 25 2021年7月17日
 バルバドス 3 23 2021年5月24日
 シエラレオネ - 22 2021年9月8日
 イラン 11 21 3 [191] 2021年5月11日
 ブルキナファソ - 21 2021年4月21日
 クリミア - 21 2021年7月1日
 アフガニスタン - 20 2021年5月24日
 北マリアナ諸島 2 19 2021年7月7日
 中央アフリカ共和国 - 17 2021年8月14日
 台湾 3 15 2021年6月14日
 グアム - 14 2021年4月26日
 ドミニカ共和国 - 14 2021年5月3日
 ハンガリー - - 14 [192] 2021年7月22日
 赤道ギニア - 14 2021年8月30日
 イラク 2 13 2021年4月27日
 モルドバ 11 11 2021年7月6日
 アルバニア 11 11 2021年7月13日
 コモロ - 11 2021年10月26日
 ジャマイカ - 10 2021年7月23日
 アンギラ - 8 2021年4月20日
 セントルシア - 7 2021年7月26日
 モントセラト - 7 2021年8月1日
 サンバルテルミー - 7 2021年8月17日
 イギリス領バージン諸島 - 5 2021年7月27日
 キプロス - 1 4 [193] 2021年5月19日
 タークス・カイコス諸島 - 4 2021年7月12日
 アゼルバイジャン - 2 2021年7月14日
 ホンジュラス - 2 2021年7月31日
 エルサルバドル - 2 2021年8月2日
 セントビンセントおよびグレナディーン諸島 - 2 2021年8月8日
 マリ - 2 2021年8月11日
 サウジアラビア - 2 2021年9月9日
 ハイチ - 1 (未報告の数)[188] 2021年7月27日
 パナマ - 1 1 [194] 2021年4月29日
 チュニジア - 1 2021年5月21日
 セーデルマンランド - 1 2021年7月7日
 ベネズエラ - 1 2021年7月7日
 モンゴル - 1 2021年9月23日
 キルギスタン - - (未報告の数)[188] 2021年5月16日[188]
 世界(178カ国) 合計:3,119,592
(B.1.617.2のみ)
合計:2,768,050
(B.1.617.2 + AY.1 + AY.2 + AY.3)
合計:1,862,122


歴史

インド国外での亜種の最初の症例は、2021年2月下旬に検出されました。これには、2月22日の英国、2月23日の米国、2月26日のシンガポールが含まれます。[195] [39] [138]

英国公衆衛生サービスの英国の科学者は、 2021年5月B.1.617.2バリアントを「懸念のバリアント」(VOC-21APR-02)として再指定しました[196]。ウイルスのバージョン。[20]別の理由は、彼らがB.1.617.2の48のクラスターを特定したことであり、そのうちのいくつかはある程度のコミュニティ感染を明らかにした。[197] [198]デルタ変異の症例が急速に増加したため、英国の科学者は、2021年6月初旬に英国でアルファ変異を追い抜いたデルタ変異をSARS-CoV-2の優勢な変異と見なしたその後、英国公衆衛生サービスの研究者は、2021年6月初旬の英国での新規症例の90%以上がデルタ変異であることに気づきました。彼らはまた、デルタ変異体がアルファ変異体と比較して家庭内感染のリスクが約60%増加したという証拠を引用しました。[200]

カナダで最初に確認された変異の症例は、 2021年4月21日にケベックで特定され、同日、同日、ブリティッシュコロンビアで39の変異の症例が特定されました。[201] アルバータ州は2021年4月22日にバリアントの単一の症例を報告した。[202] ノバスコシアは2021年6月に2つのデルタ変異体の症例を報告した。[203]

フィジーはまた、2021年4月19日にラウトカでこの亜種の最初の症例を確認し、それ以来、47,000症例に上り、数えています。[204]亜種は超拡散者として特定され、国の人口のほぼ3分の2を占める地域である 5つの都市(ラウトカナンディスバラミナウソリ)の封鎖につながった。

2021年4月29日、フィンランド社会福祉省(STM)とフィンランド保健福祉研究所(THL)の保健当局は、2021年3月にさかのぼる3つのサンプルで変異が検出されたと報告しました。[166]

フィリピンは、インド亜大陸の国々(ブータンモルディブを除く)からの渡航禁止令が課されたにもかかわらず、2021年5月11日にこの亜種の最初の2つの症例を確認しましどちらの患者も過去14日間、インドからの旅行歴はありませんが、代わりにオマーンとアラブ首長国連邦からの旅行歴があります。[205]

北マケドニアは、イラクでウイルスから回復していた人が北マケドニアに移送された後、2021年6月7日にこの亜種の最初の症例を確認しました。臨床検査では、変異が人に検出されました。2021年6月22日、国は、同じくイラクにいて、その後症状を発症した最初の症例の同僚で、デルタ変異の2番目​​の症例を報告しました。[206]

一部の国では、遺伝子検査を実施できるバリアントおよび研究所用の専用キットがないため、B.1.617の検出が妨げられていました[207] [208]たとえば、5月18日の時点で、パキスタンは症例を報告していなかったが、当局は、国内のCOVID-19サンプルの15%が「未知の亜種」であると述べた。彼らはそれをテストすることができなかったので、それがB.1.617であるかどうかを言うことができませんでした。他の国は、B.1.617に感染したパキスタンから到着した旅行者を報告しました。[207]

2021年6月、インドのゲノム統合生物学研究所の科学者Vinod Scariaは、AY.1またはDelta plusとしても知られるB.1.617.2.1変異体の存在を強調しました。これは、Delta変異体と比較してK417N変異が追加されています。[52] B.1.617.2.1は、2021年3月にヨーロッパで検出され、それ以降、アジアとアメリカで検出されています。[52]

2021年7月9日、英国公衆衛生サービスは、SARS-CoV-2バリアントに関するテクニカルブリーフィング18を発行し、SARS-CoV-2デルタバリアントの英国の45,136例のうち、致死率0.2%の28日間の追跡調査で112人が死亡したことを記録しました。[209]ブリーフィング16は、「[M]致死率は遅れた指標であり、28日間のフォローアップを完了した症例の数が非常に少ないことを意味します。したがって、症例の正式な評価を提供するには時期尚早です。他の亜種と比較した、年齢によって層別化されたデルタの致死率。」[210] ブリーフィング18は、次のように警告しています。要因。」[209] 最も懸念される問題は、アルファと比較して0.93 /週のロジスティック成長率です。これは、1週間あたり、デルタサンプル/ケースの数がアルファバリアントに対してexp(0.93)= 2.5の係数で増加していることを意味します。これにより、同じ感染防止対策の下で、大部分の人々が感染するまで、時間の経過とともにはるかに大きなケースの負荷が発生します。[211] [212]

政府の対応

第2波からの事件の増加後、少なくとも20か国が、4月と5月にインドからの乗客に旅行禁止と制限を課しました。英国のボリス・ジョンソン首相はインドへの訪問を2回キャンセルし、日本の菅義偉首相は4月の旅行を延期した。[213] [214] [215]

2021年5月、ドイツのフェルバートにある2つの高層ビルの居住者は、建物内の女性がデルタ変異について陽性であるとテストされた後、隔離されました。[216]

5月、デリー首相のArvind Kejriwalは、シンガポールからの新しいコロナウイルスの亜種は子供にとって非常に危険であり、インドで第3の波を引き起こす可能性があると述べました。

2021年5月16日から6月13日まで、および2021年7月22日から2021年8月10日まで。シンガポールは、2020年と同様に、「フェーズ2強化アラート」として知られる 封鎖に突入しました。

6月14日、英国のボリスジョンソン首相は、英国で6月21日に提案されたすべての制限の終了が最大4週間延期され、新規感染の大部分(90%)。[217]英国の科学者は、デルタ変異体は、英国で最初に同定された(ケント変異体として)以前は優勢だったアルファ変異体よりも40%から60%伝染性が高いと述べています。[218]

6月23日、カナダのオンタリオ州は、トロント、ピール、ハミルトンなどのデルタのホットスポットに住む人々のための2回目のワクチンの予約を加速しました。[219]

6月25日、イスラエルはデルタの脅威を理由にマスクの任務を復活させました。[220]

6月28日、シドニーダーウィンはデルタの発生のために封鎖に戻りました。[221] 南アフリカは、葬式以外の屋内および屋外の集会を禁止し、夜間外出禁止令を課し、アルコールの販売を禁止した。[222]

7月3日、インドネシアのバリ島とジャワ島は緊急封鎖されました。[223]

7月8日、日本の菅義偉首相は、東京が再び非常事態になり、7月23日に東京で始まるオリンピックにほとんどの観客が参加することを禁じられると発表しました。[224]

7月9日、韓国のソウルは、人々に屋外でマスクを着用するように促す制限を強化し、集会のサイズを制限しました。[225]

7月12日、フランスのエマニュエルマクロン大統領は、すべての医療従事者が9月15日までにワクチン接種を受ける必要があり、フランスは8月から医療パスポートを使用してバー、カフェ、レストラン、ショッピングセンターに入ると発表しました。[226]

ロサンゼルスは、2021年7月17日から屋内でマスクが必要になると発表しました。[227]

デルタの亜種が優勢になったために症例が急増したにもかかわらず、英国は7月19日にほとんどのCOVID-19制限を解除しました。政府はCOVID-19ワクチン接種プログラムの保護と幅広い適用範囲を引用しましたが、健康の専門家は移動に懸念を表明しました。[228] [229]

7月23日、ベトナムはホーチミン市の封鎖を8月1日まで延長し、ハノイで封鎖制限が実施され、国の人口の3分の1に影響を与えると発表しました。デルタの亜種は、2020年を通じて封じ込め措置がほぼ成功した後、これまでに国内で最大の発生をもたらしました。[230] [231]

8月17日、オークランドで肯定的な事件が報告された後、ニュージーランド警戒レベル4の封鎖に入りました。コロマンデル半島ではすぐにさらに多くの症例が続きました[232]これは、170日(2021年2月以来)で国内で最初に報告された地域感染事件であった。[233]

も参照してください

ノート

参考文献

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