PubMed Central

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PubMed Central
プロデューサーアメリカ合衆国国立医学図書館(アメリカ合衆国)
歴史2000年から現在まで
アクセス
費用無料
カバレッジ
分野
深さを記録する索引、要約、全文
フォーマットカバレッジジャーナル記事
リンク
Webサイトhttps://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/
タイトルリストhttps://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/journals/

PubMed CentralPMC)は、生物医学およびライフサイエンスジャーナルに掲載されたオープンアクセスの全文学術論文をアーカイブする無料のデジタルリポジトリです国立バイオテクノロジー情報センター(NCBI)によって開発された主要な研究データベースの1つとして、PubMedCentralは単なるドキュメントリポジトリではありません。 PMCへの提出物は、強化されたメタデータ、医療オントロジー、および各記事のXML構造化データを充実させる一意の識別子のために索引付けおよびフォーマットされます。[1] PMC内のコンテンツは、他のNCBIデータベースにリンクして、Entrezの検索および検索システムにより、生物医学的知識を発見、読み取り、構築する一般市民の能力がさらに向上します。[2]

PubMedCentralはPubMedとは異なります[3] PubMed Centralは、記事全体の無料のデジタルアーカイブであり、Webブラウザを介してどこからでも誰でもアクセスできます(再利用のためのさまざまな規定があります)。逆に、PubMedは生物医学の引用と要約の検索可能なデータベースですが、全文記事は他の場所(印刷物またはオンライン、無料または加入者のペイウォールの背後)にあります。

2018年12月の時点で、PMCアーカイブには520万件を超える記事が含まれており[4]NIHパブリックアクセスポリシーに従って原稿をリポジトリに寄託している出版社または著者からの寄稿があります。以前のデータは、2013年1月から2014年1月まで、著者が開始した預金が12か月間に103,000件の論文を超えたことを示しています。[5] PMCは、公開されたコンテンツをPMCリポジトリに保管するための何らかの能力に参加している約4,000のジャーナルを識別します。[6]一部の出版社は、ジャーナルに応じて数か月から数年の範囲の「禁輸期間」と呼ばれる、発行後の一定期間、PubMedCentralでの記事のリリースを遅らせます。(6か月から12か月の禁輸措置が最も一般的です。)PubMed Centralは、「サードパーティによる体系的な外部配布」[7]の重要な例であり、多くの出版社の貢献者契約によって依然として禁止されています。

採用

2000年2月に開始されたリポジトリは、NIHパブリックアクセスポリシー国立衛生研究所(NIH)によって資金提供されたすべての研究に誰でも自由にアクセスできるように設計されているため、急速に成長しました。さらに、多くの出版社がNIHと協力して取り組んでいます。彼らの作品への無料アクセスを提供するため。 2007年後半に、2008年の統合歳出法(HR 2764)が法制化され、NIHがそのポリシーを変更し、NIHが資金提供したピアレビュー済みの研究と調査結果の完全な電子コピーをPubMedCentralに含めることを要求する条項が含まれました。リサーチ。これらの記事は、発行から12か月以内に含める必要があります。米国政府が政府機関にオープンアクセスの提供を要求したのはこれが初めてですこれは、NIHが研究者に自発的に研究をPubMedCentralに追加するように依頼した2005年の方針からの進化です。[8]

PubMedCentralシステムの英国版であるUKPubMed Central(UKPMC)は英国の研究資金提供者の9つの強力なグループの一部としてウェルカムトラスト英国図書館によって開発されましたこのシステムは2007年1月に稼働を開始しました。2012年11月1日に、Europe PubMedCentralになりましたPubMed CentralInternationalネットワークのカナダのメンバーであるPubMedCentral Canadaは、2009年10月に発足しました。

国立医学図書館「NLM雑誌出版のタグセット」雑誌記事のマークアップ言語は自由に利用可能です。[9]学び、プロフェッショナル協会出版社協会は、「それは書籍や雑誌の両方のための学術コンテンツを準備するための標準になる可能性がある」とコメントしています。[10]関連するDTDが本に利用できます。[11]米国議会図書館と大英図書館は、NLM DTDのサポートを発表しました。[12]ジャーナルサービスプロバイダーにも人気があります。[13]

NIH以外の多くの機関向けのパブリックアクセス計画のリリースにより、PMCはさまざまな記事のリポジトリになる過程にあります。[14] これには、「PubSpace」というブランドのインターフェースを持つNASAコンテンツが含まれます。[15] [16]

テクノロジー

記事は、さまざまな記事DTDを使用して、XMLまたはSGML発行者によってPubMedCentralに送信されます古くて大規模な出版社は、独自に確立された社内DTDを持っている場合がありますが、多くの出版社はNLM Journal Publishing DTDを使用しています(上記を参照)。

受信した記事は、XSLT介して非常によく似たNLMアーカイブおよび交換DTDに変換されます。このプロセスにより、修正のために発行元に報告されるエラーが明らかになる場合があります。グラフィックも標準のフォーマットとサイズに変換されます。元のフォームと変換されたフォームはアーカイブされます。変換されたフォームは、グラフィックス、マルチメディア、またはその他の関連データの関連ファイルとともに、リレーショナルデータベースに移動されます。多くの出版社も記事のPDF提供しており、これらは変更なしで利用できます。[17]

書誌引用は解析され、PubMedの関連する要約、PubMed Centralの記事、および出版社のWebサイトのリソースに自動的にリンクされます。PubMedリンクはPubMedCentralにもつながります。これらのソースのいずれかでまだ利用できないジャーナルや特定の記事などの解決できない参照は、データベースで追跡され、リソースが利用可能になると自動的に「ライブ」になります。

社内の索引付けシステムは検索機能を提供し、一般的な薬名と独自の薬名、生物、病気、解剖学的部分の別名などの生物学的および医学用語を認識しています。

ユーザーが雑誌の号にアクセスすると、その号のすべての記事、手紙、社説などを取得して目次が自動的に生成されます。記事などの実際のアイテムに到達すると、PubMed CentralはNLMマークアップをHTMLに変換して配信し、関連するデータオブジェクトへのリンクを提供します。さまざまな受信データが最初に標準のDTDおよびグラフィック形式に変換されているため、これは実現可能です。

別の提出ストリームでは、NIHの資金提供を受けた著者は、NIH原稿提出(NIHMS)を使用してPubMedCentralに記事を寄託することができます。このように提出された記事は、通常、NLMDTDに変換されるためにXMLマークアップを通過します。

レセプション

学術出版コミュニティにおけるPubMedCentralへの反応は、一部の人による真の熱意[18]から、他の人による慎重な懸念までさまざまです。[19]

PMCは、生物医学的知識の発見と普及を強化する能力においてオープンアクセス出版社にとって歓迎すべきパートナーですが、その同じ真実により、他の人々は、出版されたバージョンの記録からトラフィックが流用されること、読者数の減少による経済的影響について心配するようになります。学んだ社会の中で学者のコミュニティを維持することへの影響として。[20] [21] 2013年の分析では、公開された記事の公開リポジトリが「ジャーナルのWebサイトからかなりの数の読者を引き離す」原因であり、「PMCの効果は時間とともに増大している」という強力な証拠が見つかりました。[22]

図書館、大学、オープンアクセスサポーター、消費者健康擁護団体、および患者の権利団体は、PubMed Centralを称賛しており、納税者の​​サポートの結果である研究出版物を自由に共有できるように、他の連邦資金提供機関によって開発された同様のパブリックアクセスリポジトリを見たいと考えています。 。[23]

オープンアクセス出版に関するAntelmanの研究では、哲学、政治科学、電気電子工学、数学において、オープンアクセスの論文がより大きな研究に影響を与えていることがわかりました[24]ランダム化試験では、オープンアクセス論文のコンテンツダウンロードの増加が見られ、出版から1年後のサブスクリプションアクセスよりも引用の利点はありませんでした。[25]

NIHのポリシーとオープンアクセスリポジトリの作業は、2013年の大統領指令に影響を与え、他の連邦機関でも行動を起こしました。

2020年3月、PubMed Centralは、コロナウイルスに関する出版物の全文の寄託手続きを加速しましたNLMは、科学技術政策局および国際的な科学者からの要請に応じて、科学者、医療提供者、データマイニングイノベーターAI医療研究者、および一般の人々のアクセスを改善するためにこれを行いました。[26]

PMCID

また、PMC参照番号として知らPMCID(PubMedの中央識別子)は、ある書誌 識別子同じよう、PubMedの中央データベースのPMIDがため書誌識別子であるPubMedのデータベース。ただし、2つの識別子は異なります。これは、「PMC」とそれに続く7つの数字の文字列構成されます。形式は次のとおりです。[27]

  • PMCID:PMC1852221

NIH賞を申請する著者は、申請にPMCIDを含める必要があります。

も参照してください

参考文献

  1. ^ ベックJ(2010)。「現場からの報告:PubMed Central、ライフサイエンスジャーナル記事のXMLベースのアーカイブ」。長期的なXMLに関する国際シンポジウムの議事録:XMLの長期保存における問題6土井10.4242 /BalisageVol6.Beck01ISBN 978-1-935958-02-4
  2. ^ Maloney C、Sequeira E、Kelly C、Orris R、Beck J(2013年12月5日)。PubMedCentral国立バイオテクノロジー情報センター(米国)。
  3. ^ 「MEDLINE、PubMed、およびPMC(PubMed Central):それらはどのように異なりますか?」www.nlm.nih.gov2019年9月9日。
  4. ^ 「デフォルトでのオープン性」、 Inside Higher Ed、2017年1月16日。
  5. ^ 「NIHMS統計」nihms.nih.gov
  6. ^ 「ホーム-PMC-NCBI」www.ncbi.nlm.nih.gov
  7. ^ Ouerfelli N. 「著者の権利:それは何ですか(PDF)
  8. ^ 「NIHの研究へのパブリックアクセスは法律を制定しました」科学コーデックス2007 2016年3月4日にオリジナルからアーカイブ取得した6年11月2013
  9. ^ 「ジャーナル出版タグセット」国立バイオテクノロジー情報センター取得した6年11月2013
  10. ^ フランス語D(2006年8月4日)。「ALPSPテクノロジーアップデート:標準XMLドキュメントフォーマット:NLMDTDの採用の事例」ALPSP 取得した6年11月2013
  11. ^ 「NCBIブックタグセット」dtd.nlm.nih.gov
  12. ^ 「米国議会図書館からのニュース」アメリカ議会図書館2006年4月19日取得した6年11月2013
  13. ^ 「IneraInc。-NLMDTDリソース」2月19日、2013年のアーカイブ2013年2月19日に。
  14. ^ 「米国連邦政府機関のパブリックアクセスプラン」cendi.gov
  15. ^ Kovo Y(2016年7月22日)。「NASA​​が資金提供した研究の結果へのパブリックアクセス」nasa.gov2016年8月19日にオリジナルからアーカイブされまし
  16. ^ 「PMCのNASA」Preview.ncbi.nlm.nih.gov
  17. ^ NLM Journal Archiving and Interchange Tag Suite、National Center for Biotechnical Information、National Library of Medicine
  18. ^ 「PLOSはオープンアクセスに関する行動について議会を称賛する」アーカイブされたオリジナルの2016年5月7日に2014年2月7日取得
  19. ^ 「連邦資金による研究から得られた査読済み学術出版物へのパブリックアクセスに関する情報の科学技術政策局へのACS提出」(PDF)科学技術政策局2014年2月7取得NationalArchives経由
  20. ^ デイビスPM(2012年10月)。「科学論文の公的寄託が読者に与える影響」。生理学者55(5):161、163–5。PMID 23155924 
  21. ^ デイビスPM(2013年7月)。「PubMedCentralからの生物医学記事への一般のアクセス可能性は、ジャーナルの読者数を減らします-後ろ向きコホート分析」FASEBJournal27(7):2536–41。土井10.1096 /fj.13-229922PMC 3688741PMID 23554455  
  22. ^ デイビスPM(2013年7月)。「PubMedCentralからの生物医学記事への一般のアクセス可能性は、ジャーナルの読者数を減らします-後ろ向きコホート分析」FASEBJournal27(7):2536–41。土井10.1096 /fj.13-229922PMC 3688741PMID 23554455  
  23. ^ 「AutismSpeaksは、家族に主要な調査結果への簡単で無料のアクセスを提供する新しいポリシーを発表しました-プレスリリース-AutismSpeaks」www.autismspeaks.org2012年7月25日。
  24. ^ Antelman、Kristin(2004)。「オープンアクセスの記事は研究に大きな影響を与えますか?」大学および研究図書館65(5):372–382。土井10.5860 /crl.65.5.372Stemper J、Williams K(2006)によって要約されています。「学術コミュニケーション:危機をチャンスに変える」大学および研究図書館のニュース67(11):692–696。土井10.5860 /crln.67.11.7720
  25. ^ Davis PM、Lewenstein BV、Simon DH、Booth JG、Connolly MJ(2008年7月)。「オープンアクセス出版、記事のダウンロード、引用:ランダム化比較試験」BMJ337:a568。土井10.1136 /bmj.a568PMC 2492576PMID 18669565  
  26. ^ 「国立医学図書館はPubMedCentralを通じてコロナウイルス文献へのアクセスを拡大しています」国立衛生研究所(NIH)2020-03-25 2020年3月31日取得このイニシアチブをサポートするために、NLMは、PMCに記事を寄託するための標準的な手順を適応させて、コロナウイルスの研究をすぐに利用できるようにする柔軟性を高めています。
  27. ^ 「引用にPMCIDを含める| publicaccess.nih.gov」publicaccess.nih.gov 20177月1取得

外部リンク

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